В колонии строгого режима, расположенной на планете Фиорина-161, единственная женщина и выжившая после неоднократной встречи с инопланетной расой Эллен Рипли, пытается устранить зараженных людей колонии, в которых происходит инкубационный период чужих.

Целью каждого уровня будет уничтожение заданного в левом углу экрана, числа инфицированных людей, причем, на прохождение каждого из уровней, у вас будет определенный отрезок времени, превышая который, вы теряете одну попытку (жизнь). Для ориентировки на местности, Эллен располагает радаром, сигнализирующим о приближении чужих.

Быстрота инопланетян, а также их непредсказуемое появление из-за краев экрана, предполагают отличное вооружении главной героини, — автомат, огнемет, гранатомет, ракетница. К каждому виду вооружения вам потребуются боеприпасы, причем, их острая нехватка, ощущается в самом начале игры. Также есть специальное оружие, — граната. Спускаясь или поднимаясь по лестницам, вы можете кинуть гранату вниз, нажав на кнопку Атака.

Чужие делятся на нескольких видов: Лицехват — слабая, но быстрая и маленькая инопланетная особь, которая рождается из кокона, раскрывающимся при вашем появлении. Чужой — взрослая особь, которая передвигается на четверых, пригнувшись, полусогнуто или в полный рост. Также их можно встретить на потолках и в вентиляционных шахтах; Главарь — намного больше своих сородичей, который является боссом между уровней, может атаковать на расстоянии кислотой; Последний главарь — отличается повышенным здоровьем, по сравнению с предыдущими сородичами.

Уровни включают в себя различные запутанные лабиринты, которые наполнены закрытыми электронными дверьми (требующими времени на открытие), движущимися межуровнемыми платформами, лестницами, шахтами (возможно, только, передвижение ползком). Некоторые из частей локации могут соединяться, выводя вас в самое начало.