Сюжет Qix рассказывает о программисте, который пытается удалить таинственный вирус с вашего компьютера. Игрок управляет маркером, чтобы заполнять первоначально пустой экран, однородными ящиками, прямоугольниками и любой другой формой, которая может быть выполнена, по средством рисования форм прямой линии. Пока вы рисуете, избегайте прикосновения вашей маркерной черты или Stix, опасного вируса Qix (выглядит в форме вентилятора) или Spritz. Любая сторона квадрата или другой фигуры, которую вы рисуете в текущий момент, до того, как она станет заполненной секцией экрана, может быть остановлена, если вирус Spritz, дойдет до контрольной точки вашего маркера..

Уровень будет завершен только после того, как вы заполните определенный процент экрана. Прохождение уровней несет в себе два способа, — быстрый и медленный: рисование медленно позволяет вам получить большее количество очков при заполнении разделов экрана, но быстрая рисовка дает вам преимущество в попытке избежать противников.

ПАРОЛИ К GAME GENIE:
PEEAPZGA — Игрок 1 начинает всего с 1-ной жизнью
PEEEAZGA — Игрок 2 начинает всего с 1-ной жизнью
IANAZZPA — Игрок 1 начинает на 5-том уровне
ZANAZZPE — Игрок 1 начинает на 10-том уровне
GPNAZZPA — Игрок 1 начинает на 20-том уровне
IEEEGZPA — Игрок 2 начинает на 5-том уровне
ZEEEGZPE — Игрок 2 начинает на 10-том уровне
GOEEGZPA — Игрок 2 начинает на 20-том уровне