NES версия игры представляет собой порт с Family Computer, который был выпущен в Японии 22 декабря 1987 года, в Северной Америке игра вышла в июне 1988 года, а позже в том же году она вышла в Европе и Австралии.

Игрок управляет военными оперативником под кодовым названием Solid Snake, который должен передвигаться по уровням не попадаясь на глаза охранникам, камерам наблюдения и всячески избегать открытых боев. Если же его все таки заметят, то игрок должен немедленно уйти из поля зрения. По сравнению с оригинальной версией игры, порт игры на NES отличается сильным изменением дизайна уровней.

Проход к последнему боссу без сражения с суперкомпьютером — когда Снэйк заходит в комнату суперкомпьютера, то остановитесь в дверном проеме и нажмите направляющую кнопку Вправо на джойстике. В успешном случае, игрок автоматически перейдет к последнему боссу, без активации таймера самоуничтожения (позволяя больше времени уделить схватке).

Легкая победа над Bull-Tank — во время сражения с боссом, игрок может сбросить его расположение, просто во время боя открыв подменю. Возможно этот трюк пригодиться, если он подойдет слишком близко, получив возможность нанести смертельный удар (для победы над боссом необходимо использовать гранатомет).

Пароли для начала и окончания игры — чтобы получить разнообразные эффекты, необходимо ввести следующие коды в опции «Passwords — Пароли»:
Все оружие и предметы — 21Z1C GZZZG UOOOU UYRZZ NTOZ3
Окончание игры — TOOOU TOOOU TOOOU TOOOU TOOOU
Последний босс побежден, на Снэйк имеет 1-вый ранг и безоружен — T1111 11611 11111 11111 11116
Заключительный этап, с небольшим количеством оружия и предметов. Впереди схватка с последним боссом — ELLEN DIANE JENNI FERBI GBOSS
Этап тюрьмы — 3LLLL LLLLL LLLLL LLLLL LLLLL
Аналогично первому паролю, но более расширенный — WZRJZ QZZZD UJ51O UIQZZ NZRZE
Начало игры с рангом в 4-ре звезды — 511111111111111111111111F
Начало игры с рангом в 4-ре звезды (с наличием некоторых предметов) — 51222 22222 22222 22222 22222
Начало на последнем уровне со всем снаряжением (включая все ключевые карты, оружием (полный запас патронов), рангом 4-ре звезды, побежденным последнем боссом — WZZZZ YZZZZ UOOOU UYRZZ VZZZK
Начало около последнего босса — 5ZRZX OZZZG COO1U UYRZZ NZRZV
Начните игру в тюрьме со всем оборудованием (кроме карты ключа № 3), всем оружием (полный запас патронов), рангом 4-ре звезды — 5LZLL LVZZZ UOOOU UORTZ TTTZZ
Начать новую игру со всем оборудованием (включая все карты ключи) — 21111 1ZZZZ 11111 111SS S1SRV
Начать новую игру со всем оборудованием (включая все карты ключи), все оружие (полный запас патрон) — 21Z11 1ZZZZ UOOOU UYRSZ KSSZT
Начните новую игру со всем оборудованием (включая все карты ключи), все оружие (полный запас патрон), рангов 4-ре звезды — 5ZZZZ YZZZZ UOOOU UYRZZ VZZZS
Начать новую игру со всем оборудованием (включая все карты ключи), рангом 4-ре звезды — 51111 1ZZZZ 11111 111SS K1SRQ
Начать новую игру со всеми картами ключами — 21111 1Z111 11111 11111 111BI
Начать новую игру со всем оружием (полный запас патрон) — 21Z11 11211 UOOOU UYR1B 1S1CJ
Начните новую игру со всем оружием (полный запас патрон), рангом 4-ре звезды — 51Z11 11211 UOOOU UYR1B 1S1CM
Разблокируйте все оружие и снаряжение — 5ZZZJ UZZJG 1CO3U UYRZR RPRZF
Перенестись к последнему боссу с 9-тью ракетными установками — DIANE JENNY SOLID SNAKE 12345

ПАРОЛИ К GAME GENIE:
SZUYPZVG — герой не получает урона от пуль
SXVTXZVG — рукопашные схватки не грозят герою уроном (в большинстве случаев)
ZASILYPA — тайная локация 1
GASILYPA — тайная локация 2
XZVSAYVZ + PAVSPNTT + AEKSZYIE — начало с увеличенным здоровьем
XZVSAYVZ + PAVSPNTT + GEKSZYIE — начало с супер-увеличенным здоровьем